下一代自动化测序平台可准确筛选数千名COVID-19患者

最新研究发现，由多伦多研究人员设计的可一次性筛查数千个COVID-19样本的机器人平台有可能彻底改变实验室追踪病毒和其他病原体传播的方式。

这份研究报告将于周三发布自然通讯，发现了下一代，超高通量测序平台C19-SPAR-Seq是由西奈卫生中心Lunenfeld-Tanenbaum研究所(LTRI)的研究人员设计的，在高峰发病期间对阳性病例的敏感性超过95%。

“快速准确地识别阳性样本对于战胜这场大流行至关重要，”多伦多大学分子遗传研究所高级研究员、教授杰夫·拉纳(Jeff Wrana)博士说。“随着新的潜在危险的变种正在流行，这是一个可扩展、自动化的平台，能够在一次仪器运行中分析数千名COVID-19患者的样本。”

Wrana博士和其他LTRI高级研究员劳伦斯·佩尔蒂埃,与多伦多大学教授本布兰考,信贷的强大的团队希望学员从其他领域的研究转向帮助开发和验证平台,允许团队从概念到发表论文在12个月。

“西奈山医院临床诊断实验室的合作是我们成功的另一个关键因素，”佩尔蒂埃说。“到目前为止，由托尼·马祖利博士领导的共享微生物实验室已经提供了数以千计的样本。”

2020年底，团队再次转向使用机器人平台通过快速测序病毒基因组指纹区来筛选数千个阳性样本的变异，以寻找关键突变。

“与LTRI的Jeff Wrana博士和他的团队合作绝对是一件愉快的事，”西奈卫生和大学卫生网络(UHN)的首席微生物学家Mazzulli博士说。“他的新型SPAR-Seq系统是尖端技术，他的团队对COVID-19样本进行实时测序的能力具有巨大的潜力，这将影响我们对该省新突变体流行病学和传播的理解。”

的平台也是划算的。该研究指出，当一次运行数千个样本时，每次测试的成本仅为8美元左右样本规模经济造成的损失。

Wrana实验室的初级研究员哈维尔·埃尔南德斯(Javier Hernandez)说，“它极其可靠，适应性强。”Marie-Ming Aynaud和Seda Barutcu。“大约需要24小时。这非常简单，因为我们已经自动化了过程中的每一步。对我来说，看到我的工作带来改变是一件非常令人兴奋的事情。”

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