科学家揭开DNA的扩展癌症，疾病风险

通过测序整个基因组DNA的修改,和分析癌症组织和健康的,哈肯萨克市子午线卫生研究人员和医生发现这可能是癌症和其他疾病的风险的关键:特定位置在这些表达式的DNA改变(甲基化)是不平衡的,根据一项新的出版物。

来自探索和创新中心（CDI），Hackensack University Center和John Archer癌症中心（JTCC）以及国家癌症学院公认的乔治城Lombardi综合癌症中心财团的作者，在主要日记中发表了他们的调查结果基因组生物学6月29日。

最强烈的疾病相关的遗传变异可以很难定位基因组的广泛扫描 - 但通过在多个正常情况下与这些DNA甲基化失衡相关的关键遗传位置进行缩小癌症组织，科学家们报告他们发现了更广泛的统计信号下面的有希望的新领域。

CDI的助理成员、第一作者、医学博士Catherine Do说:“我们密集的等位基因特异性甲基化(即由遗传变异决定的DNA甲基化失衡)地图将帮助其他科学家优先考虑和专注于与疾病相关的最相关的遗传变异。”“因为我们还深入研究了这一现象的机制，以理解它如何导致疾病易感性，我们的研究将有助于为个性化药物和药物开发确定新的有趣的生物途径。”

“癌细胞是黑帮分子，但在我们的方法中，我们让它们以一种有用的方式为我们工作，”Benjamin Tycko博士说，他是CDI实验室主任，负责监督这项研究。“这些“足迹”allele-specific甲基化比正常组织更丰富的癌症,但由于凯瑟琳的研究表明它们是由相同的生物学途径,我们可以使用密集的地图了解癌症的起源和发生自身免疫性疾病,神经,和代谢疾病障碍。”

目前的研究产生了这种方法中使用的最大的高质量数据集之一。在研究的DNA样品中，来自89种健康对照的各种组织类型，加上16种癌症样品，由肿瘤学家和外科医生在JTCC治疗的三种肿瘤：B细胞淋巴瘤，多发性骨髓瘤和胶质母细胞瘤多形形（常见而难以- 脑肿瘤）。

科学家们共鉴定了总共15,112个等位基因特异性甲基化位点，其中包括1,838个位点，位于基因组 - 宽协会研究（GWAS）的疾病易感性附近的疾病敏感性。这些数据已被公开可用，以便其他科学家可以在“后GWAS”研究中测试新假设。

同样在其新颖调查结果中，报告报告了非编码突变（不改变的证据）蛋白质序列）“可能通过远程监管效应在癌症中发挥作用基因表达”论文中引用的一个具体例子是TEAD1基因中导致等位基因特异性甲基化的突变，证据显示该基因在侵袭性和难治性多发性骨髓瘤中过度表达。

另一个发现是，一些疾病相关的遗传变异可以存在于“染色质沙漠中”的DNA中的位置，其中少数或没有可用组织类型的特异性生物信号 - 但是由等位基因特异性甲基化的足迹揭示，并且可能已经存在在细胞历史或发展阶段的不同时间有效。

“这可能是一个关键的突破在确定癌症开始和给我们一个更好的机会去如何对待它,”大卫·西格尔说,医学博士,研究所的创始董事在CDI多发性骨髓瘤、淋巴瘤,多发性骨髓瘤部门和首席在约翰·哈肯萨克大学医学中心Theurer癌症中心作者之一。“在多发性骨髓瘤中，发现导致TEAD1等基因的表观遗传激活的非编码突变，可能有助于我们锁定最有希望开发新疗法的靶点。”

“像这样的高级表观遗传研究将在不久的将来推动临床决策，”Hackensack Meridian Health和John Curer Cancer Center主任的肿瘤主任，M.S.，M.S.，M.D.，M.D.，M.S.。“这样的研究，看着DNA甲基化和基因表达的最细化变化，可以帮助我们解决癌症如何开始的谜语 - 也许如何征服它。”

我对这一重要贡献表示赞赏癌症乔治城隆巴迪综合癌症中心和MedStar乔治城癌症研究所主任Louis M. Weiner医学博士说。“这项研究发现进一步证明，将不同机构和专业的研究人员聚集在一起可以取得什么成果。”

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