信用:Albert-LászlóBarabási/ Barabasilab 2019
美国东北大学的研究人员发现了40种可能治疗COVID-19的新药物。
这发现,通过东北部的复杂网络科学研究中心周三报道,来自基于网络科学复杂数学,物理和计算的感染动态的建模工具。
该工具集描绘了蛋白质在其中的方式人类细胞在细胞被SARS-COV-2中劫持后,表现出来,这是导致Covid-19疾病的新冠状病毒。
“我们已经优先考虑了更多的药物,但我们实际上有40岁的是,我们实际上要向前迈进,”罗伯特-LászlóBarabási,Robert Gray Dodge of Networkern科学和大学杰出教授物理学教授。
巴拉贝西的团队已经在哈佛大学的实验生物学家讨论,开始在人类细胞系中测试这些药物。
我们细胞内不同种类蛋白质的相互作用在协调控制我们身体的复杂生化反应中起着关键作用。Barabási说,这就是为什么了解病毒传播的最好方法是识别人类细胞内的一整套分子相互作用,以及这些相互作用在蛋白质与细胞内遗传物质相互作用时所产生的网络。
他说:“事实上,我们所有的疾病都是通过蜂窝网络传播的。”“病毒有一种特别快速的方式,因为它正在入侵细胞,在这种情况下有26种蛋白质,有效地对网络的多个点进行非常快速和有效的扰动。”
这个模型,Barabási最初是和一群研究人员一起开发的2012年他还预测,SARS-CoV-2可能会攻击大脑细胞。报告称,这一发现有助于解释这一现象最近的报道早期的Covid-19症状包括丢失嗅觉和味道。
新的毒品清单增加了其他潜在的治疗研究人员已经确认了这一点。Barabási的模型确定了其中的几种药物,以及其他没有考虑到的药物。
“我们能够这样做的原因是,我们不局限于使用针对病毒目标蛋白质的药物,”Barabási说。“我们还可以发现针对病毒目标区域的药物。”
SARS-CoV-2进入人体后,会迅速劫持人体细胞,将其重组为病毒复制机器。冠状病毒依赖于一组突出的蛋白质,其他所有冠状病毒株都以此命名——一组类似冠状蛋白质的尖刺。当这些病毒蛋白质附着在健康细胞的蛋白质上时,它们破坏了健康细胞的基本功能,使其生产出数以百万计的病毒版本。
建立病毒感染模型的第一步是了解SARS-CoV-2攻击哪些蛋白质来劫持人类细胞。研究人员最近报道那些蛋白质中有332个。
Barabási的工具集模拟了冠状病毒瞄准的332种蛋白质的作用,并预测了这些蛋白质可能在细胞内触发导致COVID-19症状的其他机制。
该模型关注的是能够对抗该病毒的药物,而不仅仅是通过中和其刺突蛋白,因为它们最初针对的是人类细胞,但通过破坏人类蛋白质和基因内的其他相互作用。这些治疗方法在细胞内的目标区域,其中病毒作用,而不是直接靶向病毒,并且可以影响SARS-COV-2需要茁壮成长的蛋白质的方式。
“通过简单地识别病毒命中的邻居,我们可以识别在同一个社区中击中的潜在药物是什么,因此可能对病毒有效,”巴拉贝西说。
他说,最好的候选药物可能是那些不针对SARS-CoV-2最初攻击的蛋白质,但在相同的亚细胞区域内工作的药物。
“市场上很少有药物直接针对疾病蛋白本身,”Barabási说。“仅仅知道病毒以什么蛋白质为靶点还不足以让我们找到药物,我们需要很好地了解这些靶点周围的网络。”
Marinka Zitnik是哈佛医学院的生物医学信息学助理教授,二手机器学习,帮助Barabási的集团梳理已在市场上的药物或可能重新审查治疗Covid-19的临床试验。
Joseph Loscalzo,哈佛医学院的Hersey医学理论和实践教授,医学系主席,Brigham and Women's Hospital的首席医生,帮助这个团队放弃了潜力药物可能对静脉内或口服施用或不可能施用的候选者。
该团队的进度和更新正在发布在线一旦他们提供,努力帮助全球科学界,因为它在霹雳塞速度工作以解决Covid-19危机。Barabási说,一个具有更多数据和信息的报告将作为在线预印迹作为预印刷品,并提交给同行审查的出版杂志。
“我们正在释放结果,因为他们出现了,以便其他人可以立即建立在他们身上并进行研究,”他说。“在这方面取得了这么迫切需要,我们不能成为我们现有的学术或商业模式的奴隶。”
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