新的分析探讨了地理起源的流感

一个计算机模型由芝加哥大学的科学家表明,传播率小幅增加的季节性甲型流感病毒(H3N2)会导致快速进化的新菌株通过人类在全球范围内传播。这种分析的结果,2016年9月13日发表的《皇家学会学报B,加强监测开发新,季节性流感疫苗应该集中在东部地区,南亚和东南亚人口规模和社区动力学可以增加流感的流行毒株的传播。

“遗传性是病原体的特征,但它也是一个功能主机的人口,”莎拉Cobey说,博士,助理教授大学生态学和进化的芝加哥和该研究的资深作者。“所以很多人口,可能有更多的拥挤,较大的儿童教室大小,甚至某些类型的社交网络,可能维持更高传播率同样的病毒或病菌。”

有四个流感病毒循环的人口:/ H3N2, A / H1N1,和两个B变种。这些病毒传播季节每年因为被称为抗原漂移的现象:他们发展足够的逃避人类的免疫系统,但不足以完全发展成新版本的病毒。

每年H3N2亚型导致大多数疾病。基因序列分析表明,从2000年到2010年,最成功的87%,等等株H3N2起源于东方,南亚和东南亚。Cobey和她的同事们,作者弗兰克温家宝从芝加哥大学和特雷福弗雷德哈钦森癌症研究中心的贝德福德,开发了一个计算机模型来模拟条件在这些领域。

团队使用模型来测试几个假设为什么抗原上新,季节性流感菌株往往出现在这个世界的一部分,包括:

• 季节性:85%的亚洲人口生活在热带或亚热带地区没有明显的冬季,允许连续流行流感病毒的传播和更多的新菌株的进化机会。
• 主机人口规模:这个区域包含超过一半的世界人口。大量的人贡献更大的压力,在全球范围内传播。
• 主机人口流动率:出生率在这些领域一直高于其他温带地区。这可能导致更多的婴儿和年幼的儿童更容易受到流感。
• 初始条件:H3N2首次出现于1968年在香港。一个假说认为,这使病毒种群进化的开端,因此新的流行病将几乎总是开始在该地区。
• 传播率:一个给定的病毒的传播率的差异,或者预期数量的单一造成二次感染病例,会影响新菌株的进化。

Cobey和她的同事们模拟气候条件,人口动力学和模式流感流行在这些地区,发现只有传输速率有显著影响的进化有可能扩散至全球的新菌株。传输速率17-28百分比高一个地区历史上可以解释观察到的模式的流感疫情。

“总的来说,我们发现,增加了传输速度一点点大大加速速率抗原上小说菌株可以取代另一个,“Cobey说。

理解如何以及为什么季节性流感往往产生在这些领域强化监测需要确定新的毒株,不仅在亚洲受影响的地区,但与高密度人口世界的其他地方,比如西非。这也突显出公共卫生努力限制流感的传播,即广泛接种疫苗,也可以限制新出现的菌株。

Cobey表示,尽管团队的分析最初关注流感,它也适用于任何飞速发展,人类肠道病毒和传染性病毒感冒。

“他们从大陆蔓延到大陆在很短的时间尺度,所以这将是令人兴奋的,看看我们找到相似的道路一旦我们有更好的监控所有这些病毒,”她说。