新方法从宿主和病原体与一个小样本获得蛋白质签名

来自全国儿童医院的研究人员的一项小说研究表明，可以在小于平均人体活检的样品中获得宿主和细菌蛋白质签名。本文中描述的纸张 - 无偏液相色谱 - 串联质谱 - 可以改变研究人员如何研究传染病。

“这项技术可以应用于任何疾病状态，”在全国范围的儿童研究所的微生物发病中心中心的主要调查员Kevin Mason说。“患有传染病，它特别有效，因为您可以从一个样本中获得病原体和宿主的结果。”

据研究人员称，响应于感染的体内宿主蛋白和代谢物谱的第一次综合研究。此外，研究，在3月份发表的问题分子和细胞蛋白质组学，显示出在疾病期间宿主蛋白质谱的广泛表征的可行性。

“该技术的潜在影响不仅限于研究，”微生物发病中心中心的披希司法，博士学位，博士学位，博士学位说。“我们现在可以不同地思考我们如何分析个性化医学样本。”

所研究的疾病状态，由无缺乏血液嗜血虫（NTHI）引起的中耳炎培养基继续涉及医学界。随着抗生素抵抗的威胁和儿童复发性疾病的负担，中耳炎仍然是科学界的指导创新领域。

通过这项研究，研究人员通过获得耳朵感染蛋白质组学和代原景观的快照获得了新的地面。

研究团队使用未标记的蛋白质进行二维液相色谱 - 串联质谱法，以鉴定来自体内样品的肽。在用Nthi感染48小时后收集样品。虽然典型的人类活检的大小是100ug，但蛋白质组学研究所需的微小样品仅为3 ug。

“在我们使用的Chinchilla模型中，有很多遗传多样性，因为它们不是近亲动物模型，”牧师博士表示，他也是俄亥俄州立大学医学院的儿科和泌尿外科副教授。ob体育开户网址“所以我们担心可能会有太多的多样性来获得归因于疾病状态的一致蛋白质组学图片。然而，即使我们的小样本大小在差异模型中，我们也能够识别105个Chinchilla的动态变化蛋白质和66代谢物，从而定义中耳炎的早期蛋白质组学和代谢组织特征。“

最终，与健康状态相比，了解在疾病状态中激活哪种代谢途径可以为新疗法提供目标。这些疗法可以取代或支持目前用于耳感的抗生素治疗方法。并基于初始研究中鉴定的蛋白质，正在开发一种这种治疗。

该团队通过实验证明了蛋白质APR2 / 3蛋白复合物在NTHI侵袭中的作用。通过使用特异于蛋白质的抑制剂，该团队能够改变细菌侵袭，并为潜在的疗法治疗进行细菌侵袭，为中耳炎感染提供潜在的疗法。

“基于对代谢活动更深入了解的基于更深入的理解，为NTHI制定新的治疗方法的可能性是我们可以对这种疾病产生重大影响并最终对其他疾病产生重大影响，”梅森博士也是助理教授ob体育开户网址俄亥俄州州立大学医学院的儿科。“我们可以通过针对活性代谢途径的辅助疗法使病原体细胞更容易受到电流和未来治疗的影响。我们可以改善感染治疗的方式。”

根据梅森博士的说法，本文作者之间的合作对于项目的成功至关重要。多机构团队包括Joseph Kerschner，MD，院长和威斯康星医学院的执行副总裁，提供了Chinchilla Genome，以及Duke University的蛋白质组学和代谢组学核心设施的团队，他们进行了二维液相色谱 -串联质谱。

现在，该团队正在通过在疾病过程中的不同时间点收集样品进行更多的中耳炎培养基感染。“这将有助于我们建立一个蛋白质组学时间表，提供了一个令人失望的理解程度，”梅森博士说。

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