不仅仅是细菌:微生物多样性在肠道健康和疾病中的重要性

肠道菌群包含大量来自生命三个领域的微生物，包括细菌、古生菌和真菌以及病毒。它们以一种复杂的方式相互作用，促进健康和疾病相互作用的发展，由于先进的DNA测序技术在这一领域的应用，现在才得以阐明。

“使用新的宏基因组方法，科学家们终于开始描述细菌的分类丰度和群落关系，而且还包括生活在肠道环境中的其他微生物。”¹宾夕法尼亚大学费城分校的Gary Wu教授说。“这项令人兴奋的工作使我们更接近了解肠道微生物多样性的重要性健康并最终可能导致诊断和治疗胃肠道疾病的新方法。”

他的演讲是在美国佛罗里达州迈阿密举行的肠道微生物群健康世界峰会上提出的主题之一。2014年3月8-9日，国际领先的专家讨论了最新进展肠道微生物群研究及其对健康的影响。

生活在肠道中的微生物可以大致分为原核生物(细菌和古细菌)、噬菌体(感染原核生物的病毒)、真核病毒和减数动物(生活在海洋和淡水环境中的微观小型底栖无脊椎动物——主要是真菌和原生动物)其中，对细菌的研究最为广泛。胃肠道现在被认为是地球上最复杂的微生物生态系统之一，了解多个群落如何相互作用既带来了机遇，也带来了挑战。

吴教授说:“我们已经知道肠道中的细菌在健康和疾病中发挥着重要作用。”“现在也越来越清楚，非细菌微生物群与细菌微生物群以复杂的方式相互作用，从而促进了这些过程。”

肠道内的病毒

肠道中最常见的病毒是噬菌体。这些快速进化的病毒在数量上是细菌的10倍;它们感染并破坏细菌细胞，并具有将遗传物质从一种细菌转移到另一种细菌的能力，对胃肠道健康和疾病具有潜在的深远影响。

Wu教授说:“噬菌体和细菌之间存在一种捕食者-猎物关系，可能在炎症性肠病(IBD)等疾病中改变细菌微生物群方面发挥作用。”“噬菌体在细菌中诱导免疫反应，也可能将基因组物质传递到细菌中，从而改变它们的功能，这一事实使这些细菌产生了免疫反应病毒非常重要，我们需要了解更多。”

微生物群中的Meiofauna

DNA测序技术也证实了胃肠道中共生减数动物的存在，这可能对促进健康和疾病有重要作用某些类型的减数动物(如蠕虫和酵母菌属)被认为可以通过抑制炎症来预防IBD，而其他人则认为真菌多样性的增加可能会导致包括IBD在内的胃肠道疾病。

“真菌多样性的下降已被证明与益生菌治疗后健康细菌定植的增加有关，这表明真菌和细菌之间存在利基竞争。细菌吴教授说。“这种影响在粘膜的发育中也很明显假丝酵母抗生素治疗后感染。”

非细菌微生物和未来

吴教授和其他人认为，跨领域相互作用在健康和疾病中的重要性才刚刚开始显现。通过研究人体中细菌和非细菌微生物之间的复杂关系肠道在美国，希望对致病机制有更多的了解，最终导致新的诊断和治疗方法。