新技术揭示了RNA:研究人员开发了一种可以增强基因测序数据的方法

密歇根大学综合癌症中心(University of Michigan Comprehensive Cancer Center)的研究人员开发了一种技术，以更好地理解为什么癌细胞中的RNA可能与正常细胞不同。这项技术将使人们对肿瘤全基因组测序的测试有更深的理解。

当研究人员对核糖核酸的癌症细胞，他们可以将其与正常细胞进行比较，看看哪里有更多的RNA。这可以帮助他们找到可能引发癌症的基因或蛋白质。

但除了发现几个已知的煽动者，这意味着什么?有更多的RNA是因为它合成得太快还是因为它降解得不够快?什么部分的生物平衡是关闭的?

经过十多年的研究，密歇根大学综合学院的研究人员癌症中心已经开发出一种技术来帮助回答这些问题。

该方法涉及一种名为溴啶的化合物，它可以用来标记或标记新生成的RNA。研究人员将溴化啶应用30分钟，然后分离RNA，看看新的RNA是在哪里产生的。他们称这个过程为bro - seq。

另一方面，研究人员可以在不同时间用含有化学尿苷的漂洗剂跟踪溴化啶标记。他们称其为BruChase-Seq，因为尿苷会驱赶新生成的RNA，所以他们可以观察RNA在1小时、2小时或6小时内的衰老过程。换句话说，RNA是否像它预想的那样在降解?

“我们可以看到所有合成的RNA的整体模式，以及所有稳定的和降解的RNA。我们可以按照合成和稳定,看看一个特定的RNA更稳定的癌细胞比正常细胞或如果它是花更长的时间来降低癌细胞比正常细胞,”研究作者垫Ljungman说,博士,副教授放射肿瘤学在密歇根大学医学院

“通过我们的技术，我们可以将“如何”的图像增加10倍的深度基因他补充道。

Ljungman是癌症中心新转译项目的成员肿瘤学该项目汇集了来自密歇根大学的癌症研究人员，以加快将基础科学转化为临床试验，并为患者提供新的治疗机会。

癌症中心目前正在使用基因测序技术，帮助晚期癌症患者匹配基于其肿瘤组成的潜在临床试验机会。

除了帮助癌症通过测序，Ljungman认为这项新技术有可能帮助识别糖尿病或炎症等疾病。在介绍该技术的论文中，在线发表于美国国家科学院院刊，研究人员描述了他们如何使用它来理解细胞的炎症反应。研究人员还使用这项技术来检测血液样本。

随着更多的研究，Ljungman设想有一天这项测试可以作为一种监测RNA变化的方法提供给看医生的人。

“如果从一个测试到另一个测试有显著变化，这可能是一个危险信号或疾病的早期预警信号。”这将是这项技术最广泛的应用，”永格曼说。

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