删除绑定网站一个致癌基因可以减缓癌细胞的生长

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CGE方法的策略lineage-trace细胞不同的基因组编辑事件使用序列标签用沉默或近乎宁静突变。,HDR模板的CGE方法使用一个图书馆和两个实验变异:原始基因组序列(蓝色)和所需的突变(橙色)。此外,HDR模板港序列标签,可以确定目标轨迹的Illumina公司测序,使血统追踪的克隆编辑和创建大量的内部复制在每个实验。变异所产生的序列标记核苷酸侧翼感兴趣的区域的概率24%,策略通常介绍2 - 3突变核苷酸(以红钻石表示;扩展数据图1),使得大部分的旁侧序列完整,显示的位置权重矩阵。b,实验策略使用HDR的混合模板库窝藏的原始和突变序列相同的目标。丰富的细胞群中的每个HDR模板分析的序列标签后各自不同的化验和比较基准:细胞健身(gDNA在第8天/一天2),TF绑定(chromatin-immunoprecipitated DNA /输入DNA)和(mRNA丰富/各自gDNA) mRNA表达。c,许多可能的序列变化为零(n = 1),一个(n = 30),两个(n = 405)和三(n = 3240)侧翼序列标签时突变是由十核苷酸变异的概率24%,丰富的HDR模板库分析从读计数芯片的输入样本编辑SHMT2 E-box轨迹。箱形图表示中位数读计数与上、下四分位数,和胡须四分位范围扩大到1.5倍。找到序列标签的数量在每个实验中补充表3所示。 d, The effect of E-box mutation at the RPL23 gene promoter on fitness of HAP1 cells shown by read count ratios for mutated/original sequences for each cell lineage pair harboring identical sequence tags with one flanking mutation. Credit:自然生物技术(2022)。DOI: 10.1038 / s41587 - 022 - 01444 - 6

研究人员关注MYC癌基因的影响揭示了新信息的因素调节肿瘤细胞的生长。MYC促进细胞增长的重要基因的表达,它是活跃在超过半数的人类癌症。然而,目前还没有药物可以抑制MYC函数,因为它的蛋白质结构并不适合治疗的目标。选择预防MYC活动会抑制MYC目标基因的功能。在最近的研究中,研究人员芬兰赫尔辛基大学属于学院的卓越中心的肿瘤遗传学的研究已经确定了目标的MYC基因负责经济增长的促进作用。

“在一个健康的组织,和扩散是严格控制的过程。在癌症的发展,细胞逃避这些和肆意地生长,”高级研究员解释说Paivi Pihlajamaa。

研究人员发现MYC癌基因的基因组结合位点的监管区域目标基因和显示,删除这些结合位点DNA减慢细胞生长。这项研究最近发表在自然生物技术

“我们的研究结果表明,细胞DNA变化很小,如修改单个基因调控元素,可以显著影响细胞的增殖率,”证实了Pihlajamaa。

这些发现可能在未来许多癌症患者受益。

“更好的理解机制,控制细胞的增长可以帮助确定目标可以被新癌症药物,”Pihlajamaa告诉。

进一步研究新方法的好处

本研究的另一个主要影响来自由研究人员开发的一种新方法。重要的是,它使测量的影响变化的小DNA元素在细胞增长强劲和精确。

“未来的研究方法是非常有益的,因为它可以用于研究各种变异如何影响其他细胞增殖和属性,“组长Jussi Taipale教授解释道。

该方法是基于所谓的遗传剪刀,即CRISPR-Cas9系统,最近已成为生物医学研究的一个重要工具。ob欧宝直播nba系统吸引了很多关注,因为它使基因组编辑效率和精度高。

基因组编辑过程,然而,诱发DNA损伤反应,影响细胞的生长。因此,研究人员必须能够区分的影响感兴趣的突变引起的基因组编辑过程本身。

“我们的方法解决了这个问题通过使用一个实验性的策略的细胞发生了基因组编辑直接与对方相比,和未经审查的野生型被丢弃的分析,“Taipale告诉。

“这是一个功能强大的方法,可以在阐明产生重大影响的过程控制细胞增长在未来,“Taipale总结道。

更多信息:Paivi Pihlajamaa et al,竞争精密CRISPR方法识别转录因子结合位点的健身效果,自然生物技术(2022)。DOI: 10.1038 / s41587 - 022 - 01444 - 6

期刊信息: 自然生物技术

所提供的赫尔辛基大学
引用:删除绑定网站的致癌基因可以减缓癌细胞的生长(2022年9月27日)检索2023年7月20日从//www.puressens.com/news/2022-09-sites-oncogene-cancer-cell-growth.html
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