研究人员解决了人类转录因子(TF)调节

研究人员解决了人类转录因子(TF)调节
研究的TF和TF家族的综合蛋白质相互作用。基于内圆的TF家族的颜色编码(节点颜色)组织了研究的TF,并且相互作用的蛋白质与白色相互作用。蓝色边缘表示与生物分析分析检测到的相互作用,与AP-MS分析和两者的绿色相互作用。b由生物分子和AP-MS检测到的不同TF家族的PPI平​​均数量。请注意,TF家族的颜色编码与A)中的颜色编码相同,并且TF家族基于生物盆地数据将三个垃圾桶组织成三个垃圾箱,首先具有具有150-100个高信仰相互作用/诱饵TF的家族,第二个100-50和第三<50互动/TF。与AP-MS检测到的稳定相互作用显示与相互作用数量相关。但是,KLF家族的表现不同,平均相互作用的数量比任何其他TF家族都高2倍。该图的源数据作为源数据文件提供。学分:doi:10.1038/s41467-022-28341-5

赫尔辛基大学的一个研究团队介绍了一项关于人类转录因子的新大规模研究,结合了两种最先进的相互作用方法,允许快速鉴定蛋白质 - 蛋白质相互作用和该重要基因家族的广泛功能信息。

转录因子(TFS)是细胞发育,分化和维持稳态的最重要的蛋白质群。它们在各个发育阶段驱动细胞中基因表达的复杂模式。TF信号的缺陷通常会导致发育障碍和疾病。

但是,尽管已经广泛研究了TF DNA结合,但我们仍然缺乏对TF活性和信号传导如何通过与多种蛋白质(例如辅助伴侣,二聚伴侣,染色质调节蛋白质,酶,抑制性蛋白质)相互作用来控制的系统级别的理解。和一般

赫尔辛基大学的一项研究团队决定发起一项大型研究,以阐明TF蛋白 - 蛋白质相互作用和TF调节。新研究发表在自然通讯

Hilife生物技术研究所的研究总监Markku Varjoso说:“我们引入了100多个TF的全面相互作用分析,揭示了7,000多种TF蛋白 - 蛋白质相互作用,其中大多数具有核蛋白质相互作用,在转录调节中起着重要作用。”

调查结果为TF调节的进一步研究铺平了道路

在这项研究中发现的大量TF相互作用使研究人员能够进行系统级分析,该分析揭示了具有特定生物学功能的TF组,例如染色质重塑和RNA剪接。

“有趣的是,几乎一半的研究TF与TFS的核因子家族相互作用。已知核因子可以控制大量基因和发育过程中的器官发生及其异常活性与几种人类癌症类型有关。我们的数据表明,转录控制该研究的主要作者HelkaGöös博士说:“由NFIS与其他TF相互作用可能受到核因素相互作用的调节。”

该研究提供了有关人类转录因子的物理和功能相互作用的第一个全面和免费的概述。新发现为TF调节的进一步研究铺平了道路。

“我们的实验室一直在识别和研究个体疾病机制的过去十年中癌症和免疫缺陷的因子突变。事实证明,TF是困难的药物靶标,但是他们的几个关键调节剂更有前途。我们生成的有关TFS的大量信息可以作为药物发现研究的丰富资源,以鉴定与TF相关疾病的药物治疗。” Varjosalo博士说。


进一步探索

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更多信息:HelkaGöös等人,人类转录因子蛋白相互作用网络,自然通讯(2022)。doi:10.1038/s41467-022-28341-5
期刊信息: 自然通讯

由...提供赫尔辛基大学
引用:研究人员解决了人类转录因子(TF)法规(2022年2月9日),于2022年6月17日从//www.puressens.com/news/2022-02-human-transcription-factor-tf.html检索
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