IBD基因候选orf对HT-29转录组的影响选择的例子说明了IBD候选基因不同orf表达后对HT-29细胞转录组的影响。HITS被鉴定为在HT-29(内源性或随ORF表达)中显示可检测表达的基因，与基线相比，响应给定ORF表达的折叠效应大于2，且表达超出预期范围。例如，代谢途径中的末端酶FUT2(左)对转录组没有影响(0 HITS);NOD2(中)是一种细胞内PAMP受体，在其配体缺失的情况下，对转录组(28 HITS)的影响很小，而已知在肠上皮细胞中起核心作用的转录因子HNF4A的影响最强(1123 HITS)。每个点代表一个来自全基因组阵列的可检测探针，标记HT-29转录组中的特定基因。x轴显示所有条件(基线)的log2转换中值表达式。y轴表示给定ORF的转导效果，作为与基线相比的log2转换的折叠诱导。天蓝色圆点表示表达值在预期变化范围内的探针(|Z|≤2)，橙色圆点表示在预期变化范围外的探针(|Z| > 2)，红色圆点表示在预期变化范围外的探针(|Z| > 4)。灰色点为表达值低于检测阈值的探针。 B Impact of the expression of all IBD gene candidates on the transcriptome of HT-29 cells. ORFs are ordered along the x-axis by increasing total number of HITs (see Additional file 1: Table S5), with number of upregulated and downregulated HITs gene shown along the y-axis. Starred ORFs are previously reported IBD candidate causal genes and ORFs listed in red indicate known transcription factors (as defined by Lambert et al. [38]). Credit: DOI: 10.1186/s13073-021-00996-7
蒙特利尔心脏研究所和Université de Montréal的一个研究小组已经表明，存在于特定肠道细胞中的基因可以防止炎症性肠道疾病的发展。今天发表在科学杂志上基因组医学研究结果显示，这些基因中有十几种有助于克罗恩病和溃疡性结肠炎的发展，它们有助于对抗病毒和细菌感染。
