COVID-19 lab-leak假说:似是而非,但并不意味着有目的的基因改造
昨天七国集团(G7)峰会结束时,领导人呼吁新鲜和透明的调查来确定COVID-19流感大流行开始了。
我欢迎兴趣重燃的潜在“lab-leak”起源SARS-CoV-2,导致COVID-19的病毒。它不会是第一次传染病病原体是一个研究实验室意外释放。
我知道从个人经验。早在1994年,斯坦福大学奖学金的第一天,我拿起一个潮湿的快递包裹在接待并把它回实验室。我的教授立即戴上乳胶手套。包裹中包含一个瓶感染艾滋病毒的淋巴结。
干冰用来包示例已经蒸发了,浸泡纸板。我,有人没有使用过艾滋病毒,用手湿处理含有活病毒的一个盒子。
我没有被感染。但是经历让我敏锐地意识到事故发生的难易程度。一个2018审查发现27例感染实验室获得1982年和2016年之间在亚太地区。病原体的列表包括从导致登革热的病毒SARS冠状病毒。
美国生物安全协会(ABSA)维护检索数据库的报告实验室获得的感染。文档”泄漏的塑料袋负压输送室”和“水滴在清洗泄漏”,在许多其他的例子。
仅从科学的角度来看,重要的是探讨lab-leak假说,因为如果这是真的,我们必须加强安全措施防止未来的泄漏。
两个lab-leak假说
当病毒首次报道从武汉近18个月前,人们提出了这样的可能性,它出现在武汉病毒学研究所对SARS冠状病毒的研究正在进行中。
这lab-leak假说有两种味道。首先,病毒可能会从一个动物(或动物组织)感染SARS冠状病毒的研究。受感染的人随后在社区感染别人。
一种病原体的转移从一个动物到人类被称为动物传染病的传播。这个过程也在实验室以外发生也许当有密切接触受感染的动物或它们吃。
第二个假设表明有目的的基因改造的冠状病毒引起了更多的传染性和人类传播的变异,从而泄露到社区。这种类型的基因改造叫做功能,因为工程病毒获得新的生物特征。
是武汉病毒学研究所运行GoF实验从蝙蝠SARS-CoV-2病毒吗?如果是的话,这可能会开始Covid-19大流行。https://t.co/jmLXhCW4DX
——《福布斯》科学(@ForbesScience)2021年6月14日
不幸的是这些假设被角色分配不当是等价的,并且经常被描绘成替代“自然起源”假说。
当我和其他计算生物学家认为的起源,我们考虑进化祖先:病毒的进化的后裔。如果SARS-CoV-2从一个祖先进化而无需人工干预变异中发现一个或多个主机,很有可能这样的宿主动物,或从受感染的宿主动物样品,在实验室研究的主题。
通过一些不幸的灾难,这是合理的,有人在实验室感染。
调查为什么重要
支持或反对这些假设常常表达所说的可能性。今年2月,世界卫生组织(世卫组织)上市的四个场景全球SARS-CoV-2起源的研究:直接人畜共患传播,间接传播人畜共患通过一个中间宿主,通过冷/食物链传播产品和实验室意外释放。
间接传播人畜共患通过一个中间宿主被认为是“可能”很有可能和意外实验室发布“极不可能”。谁故意操纵功能小组拒绝了,因为它“已经被其他科学家排除后基因组的分析”。
但这还不是最后一句话,因为COVID-19病毒的确切起源仍是一个谜。
SARS-CoV-2表明病毒的基因组测序(大约96%)有关应变在马蹄发现蝙蝠。虽然这似乎是一个高水平的相似性,这意味着SARS-CoV-2偏离这一毒株几十年前。因此,目前尚不清楚如果溢出是人类直接或通过一个中间物种。
在任何情况下,这种进化分析外不能区分传播或实验室。
世卫组织的小组认为lab-acquired感染可能性微乎其微,因为武汉实验室的严格的生物安全协议。但是ABSA数据库列表意外感染发生即使在最高的实验室生物安全认可,这些包括发热、感染。
赞成和反对的理由实验室意外释放,世卫组织的报告指出,武汉实验室搬到一个新的位置附近的华南市场2019年12月初,但“报道没有中断或事件引起的举动”。没有理由不信任世卫组织专家小组的结论,但尽管如此,实验室搬迁出现错误的机会。
lab-leak假设至少是合理的,因此重要的调查。如果是实验室的相关操作,或其搬迁,我们需要重新审视安全协议。对于搬迁,我们想可能需要独立监测和预处理和post-move检疫的重要人员。