研究发现COVID-19变异可能提供线索在预测患者病毒进化的结果

COVID-19大流行以来,突变导致COVID-19-have SARS-CoV-2-the病毒传播到美国和全世界其他国家。最近的研究表明,当前COVID-19变异70%比大流行性流感的传染性原始菌株。

多学科小组的克利夫兰诊所和凯斯西储大学的科学家使用基因组测序跟踪SARS-CoV-2俄亥俄州东北部,突变,从3月11日到4月22日,2020年。该研究成果发表在《美国医学会杂志》网络开放,证明了初始压力和子组病毒菌株(称为演化支),在这个时期,是与高死亡率而新变异降低住院和死亡。尽管这些发现分享见解研究人员学到了什么大流行的早些时候,它还可以帮助指导分析新变异如何影响未来的研究病人的结果随着该病毒继续发展。

这项研究合作,由弗兰克·埃斯珀,医学博士儿科传染病医生在克利夫兰诊所儿童,包括癌症基因组学专家、计算机和数据科学、神经学和病理学。布莱恩·鲁宾,医学博士主席Robert j . Tomsich病理学和实验室医学研究所,克利夫兰诊所,和李Jing,博士伦纳德的情况。计算机和数据科学教授,凯斯西储大学在研究文章的第二作者。

为了更好地理解如何变异和演化支改变临床结果早些时候,灵异少女和博士的研究小组分析了RNA序列的数据从302年COVID-19患者的第一波大流行期间东北俄亥俄州。这些临床样本来自克利夫兰诊所的COVID-19注册表,收集的数据来自近50000个病人检测这种疾病。

通过测序每个标本对病毒的初始应变在武汉,发现中国灵异少女博士和研究小组发现488的突变,关联有六个病毒株(演化支武汉、S、L, V, G GH)。

结果显示,在最初的六个星期大流行在克利夫兰,早期的病毒株是建立和导致更高的疾病死亡事件。然而,在数周内这些早期的病毒株超过了更强的传染性病毒,降低住院和增加病人生存即使住院。

“这项研究提供了一个详细描述的不同COVID-19演化支进化,一旦他们被带到克利夫兰,”鲁宾博士说。“病毒演化支结果的联系非常重要和突出的重要性,病毒基因组测序获得更深的理解新疾病。”

COVID-19最大的多样性菌株发生在第一个星期前社区建立了策略限制病毒传播。州和联邦的反应可能很可能阻止继续引进新变量以外的社区,从而降低总体死亡率。

“这些发现提供了更深入地了解如何COVID-19感染显著超过了COVID-19住院和死亡的发生率随着流行的进展,”埃斯珀博士说。“研究也有助于验证病毒演化支如何发挥重要作用在预测病人的结果。”

“这项研究进一步证实了研究基因变异的重要性在流感大流行的病毒,”李补充道。“这也清楚地显示团队的价值公民的高度集成和互动的团队有不同的优势和专业知识但共享视觉处理的挑战。”

病毒不断变异随着时间的推移,专家并不确定疾病的严重性或新变异会导致死亡。广泛的疫苗接种是一个重要的公共卫生策略慢病毒的传播。广泛的疫苗将有助于减少潜在致命的变种的出现。直到群体免疫achieved-which专家估计约70 - 80%的人口是vaccinated-everyone应该继续面具,社会距离,经常洗手,避免聚会。目前,只有34%的美国人完全接种疫苗,而52%收到至少一个剂量,据美国疾病控制和预防中心。