新软件提供COVID-19病毒变异多样性的详细图片

“B.1.1.7。”“B.1.351。”在COVID-19大流行之前，这些只是一系列随意的字母和数字。现在，我们将其理解为“担忧的变种”，即具有独特遗传密码的SARS-CoV-2病毒。

这些变异仅仅代表了病毒遗传多样性巨大树中的两个分支。随着病毒在人与人之间的传播，它会不断进化并开始感染基因突变，形成了一个由不同病毒谱系和变种组成的庞大的冠层。西方开发的开源生物信息学管道和网络应用程序的核心是，以一种可访问的方式为研究人员、公共卫生专家和社区成员可视化地表示CoVizu。

世界各地的基因组监测项目每天都在收集有关这些突变的数据，迄今已确定了30多万种新型冠状病毒的独特基因版本，它们被分为“谱系”或“变异”类别。

B.1.1.7和B.1.351的突变使病毒具有更强的潜在传染性，与它们不同的是，许多变异不能明显改变病毒的行为方式。然而，它们确实有助于描绘一幅信息丰富的流行病学图景。仔细检查这一广度的基因信息可以帮助追踪病毒是如何在人群中传播的，确定暴发，并可能查明下一个值得关注的变种。

舒利克医学与牙科学院副教授、CoVizu的主要开发者阿特·潘博士说:“我们正在努力做的是提供一些关于病毒如何传播的估计。”通过追踪所有这些变异，这款网络应用可以直观地显示出病毒的所有变异，以及在全球传播过程中病毒的基因变化。

Poon说:“我们也立即意识到有如此多的数据，我们需要让用户以一种有意义的方式进行搜索。”

通过创建CoVizu，他和他的研究团队将从世界各地超过50万个病毒样本中收集到的大量基因组监测信息提炼为易于理解的视觉表示。树形图显示了不同的变异是如何相互联系的，而“珠子图”显示了世界上何时何地对该变异进行了采样，以及这些样本是如何联系的。

该软件的所有数据都是由gisaid提供的，这是一个全球科学倡议开放获取实时获取病毒基因组数据。到目前为止，CoVizu是其中之一全球15个由GISAID授权的软件合作也是唯一在加拿大开发的。

这款西方开发的软件允许用户根据样本数量、采集日期或原产国来过滤数据。它还显示了病毒的每个谱系自从从共同祖先分化以来积累了多少突变的可视化表示。

“这个项目的一个主要部分是使这些数据易于获取和提供信息，这样普通人可以看到它，并理解这些数字对他们意味着什么，”Emmanuel Wong说，他是一个硕士研究生，由Poon监督，他是CoVizu开发团队的一部分。“它所做的是让人们看到这些变异，并了解它们是如何来到这里的，以及它们从哪里来的。”

该团队包括Roux-Cil Ferreira, Molly Liu, Kaitlyn Wade, Laura Muñoz-Baena, Gopi Gugan和Abayomi Olabode，他们希望这个软件将帮助流行病学家和公共卫生专家如何跟踪病毒在人群中移动并识别出不同的担忧。

CoVizu致力于在我们的工具包中提供另一个工具来理解遗传多样性”Poon说。“我们知道基因组流行病学很重要，拥有这些数据也很重要，因为通过共享数据，我们可以看到和识别担忧的变异。”

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