研究人员简化了基因环境相互作用的研究

Weill Cornell Medicine和Cornell University的Ithaca校园的研究人员开发了一种新的计算方法，用于研究遗传和环境相互作用以及它们如何影响疾病的风险。

该研究于1月7日发表美国人类遗传学杂志，使发现​​这些相互作用的过程变得更加困难，并证明它们在确定体重指数和糖尿病风险方面的重要性。

“我们的研究表明，您的基因很重要，环境很重要，并且两者的相互作用可以增加疾病的风险，”合作培训的作者Olivier Elemento博士说，他是计算生物医学的计算基因组学教授，生理学教授。生物物理学，HRH Prince Alwaleed Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Alsaud Alsaud Institute for Computational Biomedicine副主任，Weill Cornell Medicine的Caryl和Israel Englander Precision Precision Precision Institute主任。

Weill Cornell医学科学研究生院的博士候选人Andrew Marderstein说，研究基因环境互动会引起巨大的计算挑战。在伊萨卡的实验室，使他能够立即获得计算生物学和人群健康专业知识。

“基因型 - 环境的互动可以被认为是某些基因型对环境侮辱的敏感性，”共同培训和雅各布·古尔德·舒尔曼（Jacob Gould Schurman）的人口遗传学教授克拉克博士说，分子生物学和雅各布·古尔德·舒尔曼（Jacob Gould Schurman）教授艺术与科学学院的遗传学以及康奈尔大学的南希和彼得·梅尼格家庭调查员。“这些恰恰是饮食或其他暴露的变化可能在健康方面取得最大改善，但仅适用于一部分个人。”

数百万的遗传变异或继承遗传差异在人口中的个人以及不同的生活方式和环境因素，例如吸烟，运动，不同的饮食习惯，可以通过多种方式分析合并效果。当研究人员测试基因环境相互作用时，他们通常以成对的方式分析数百万个数据点，这意味着他们一次评估了一种遗传变异及其与一个环境因素的相互作用。Marderstein说，这种类型的分析可能会变得非常密集。

新的计算方法优先考虑并评估基因组中的基因组中较少数量的变体，或者是人体中发现的完整遗传物质，用于基因环境相互作用。Marderstein说：“我们凝结了一个问题，分析了1000万种不同的遗传变异，从本质上分析了基因组不同区域中的数十种变异。”

尽管标准的遗传关联研究可能会研究单个遗传变异是否会导致体重指数的平均变化（BMI），但本研究评估了哪些遗传变异与个体更可能具有较高的BMI或更低的BMI相关。研究人员发现，寻找与人类特征中的方差相关的DNA段，称为方差定量性状基因座或VQTL，使它们能够更容易地识别基因环境的相互作用。值得注意的是，与体重指数相关的VQTL也更有可能与具有较大环境影响的疾病有关。

Marderstein说，新的计算方法可能有用的另一个研究领域是确定个人如何基于基因环境相互作用对特定药物做出反应。对健康的社会决定因素的分析，意味着一个人的环境和社会状况，例如贫穷水平和教育程度根据Elemento博士的说法，这是研究人员追求的第三个领域。

总体而言，除了评估空气质量和体育锻炼之类的环境因素外，精密医学领域的科学家还可以对一个人的DNA进行测序，以更好地了解个人是否有患一种特定疾病的风险。Elemento博士说：“沿线的想法是在诊所使用这些概念。”“这是精密医学演变的一部分，现在我们可以很容易地对某人的基因组进行测序，然后有可能分析与发展特定疾病风险相关的遗传景观中的所有变体。”

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