开源工具包帮助发展中国家满足对COVID-19研究和诊断的需求

研究人员开发了一个免费的开源工具包，允许发展中国家的实验室为Covid-19研究和诊断制作自己的工具，而无需依赖越来越突破的全球供应链。

每天对数百万次COVID-19检测的高需求加上中断全球供应链留下了许多面临诊断短缺的国家。最近自然非洲疾病控制和预防中心主任John Nkengasong说:“全球合作的崩溃把非洲赶出了诊断市场....非洲国家有资金支付试剂，但无法购买。”

因此，为了克服这一挑战，世界各地的科学家正在开发更快、更便宜、适应当地卫生系统需求并易于制造的新检测方法。

使科学家能够访问他们需要的研究工具,研究人员开放Bioeconomy剑桥大学的实验室,实验室de Tecnologia自由泳iBio /斯坦福大学举办的智利和FreeGenes项目与合成生物学公司银杏生物工作室设计一个开源工具包这使得研究人员能够生产出16种最有用的酶，用于检测导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的多种诊断技术。

剑桥大学化学工程和生物技术系的Chiara Gandini博士说:“设计这些藏品是具有不同专业知识和当地不同需求的研究人员之间的伟大合作。”“我们在设计时考虑了其他生物学家，让他们尽可能容易地根据自己的需求重新配置工具箱。”

“分子诊断工具包'包括用途DNA生产，以产生包括DNA聚合酶和逆转录酶的酶 - 用于金标准RT-QPCR试验中使用的酶。这些酶也可用于测试灯，比RT-QPCR更快，更简单，并通过更多的实验室迅速采用。控制DNA还包括在工具包中以验证测试将专门检测SARS-COV-2但不相关的病毒。

分子诊断工具包使用标准实验室技术来生产和净化酶，但在挑战性资源限制下全球南方工作中的许多研究人员可能需要将其工作适应局部可用性的材料。因此他们可以利用“大肠杆菌蛋白表达工具包'：超过100个DNA部件的集合可以组装成千上万的组合，以定制整个生产过程。例如，将模块包括以将酶结合到纤维素中以产生基于纸的测试或激活酶利用发光二极管而不是昂贵的化学物质来制造电池。

该工具包已通过来自16个国家的34个实验室预订，包括巴西，智利，秘鲁，哥伦比亚，哥斯达黎加，墨西哥，喀麦隆，埃塞俄比亚，印度和越南。

“访问这种分子工具的调色板对于我们的地区至关重要，以便在短期内争取任何试剂供应短缺，并长期利用技术自主权，”塔玛拉·斯托利卡（Pontificia UniversidadCatólica）说智利和Ibio参加了集合的设计。Matute的同事ISAACNúñez补充说，也需要通过同行支持提高集合的有用性等机制，包括培养“协作社区，人群议定书和公开共享资源”。

虽然工具包的初始焦点是支持研发，但同样的DNA可用于制造具有正确的流程和监管批准的诊断套件。由于它是开源，任何公司或机构都能够从工具包中生产和商业化酶。例如，灯泡酶将在埃塞俄比亚生物技术研究所制造，并与剑桥非洲阿尔博拉达基金支持的剑桥大学合作。

Brook Esseye博士的EBTI灯倡议表示，“这项倡议将加强生物制造业的当地能力，并加强各国研究人员之间的伙伴关系，因此我们可以携手共进抗击这一全球大流行。”

超越Covid-19，当地的生物制造能力可以基于生物技术研究，教育和创新的其他进步。

“诊断的弹性本地供应链对于未来的健康安全和大流行准备至关重要，”剑桥化学工程系和生物技术系的班尼·莫罗博博士说。“用于检测Covid-19的相同酶也可以检测疟疾，伤寒和许多其他疾病。它们可以应用于许多其他方式来实现积极的社会和经济影响，包括研究更好的作物，测量保护的效果生物多样性和跟踪抗生素抗性的倡议。这种灵活性是为什么它非常重要，即生物技术的主要工具可访问，用于世界各地的所有研究人员。“

该工具包已在开放材料转移协议（OpenMTA）下自由提供，这为收件人提供了明确许可，可以向其他实验室分发并使用工具包进行商业目的，可以通过斯坦福大学的免费基因项目在线订购。

该工具包的研究人员和用户被邀请通过Reclone论坛。

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