团队分享将学术研究中心改造为SARS-CoV-2检测实验室的蓝图
在COVID-19大流行期间,由于对SARS-CoV2诊断检测的需求远远超过供应,学术研究科学家已经开始将实验室转变为检测设施。在5月10日发表的一篇论文中Med.是来自波士顿大学医学院和波士顿医疗中心(BMC)的调查员团队概述了他们如何调整其实验室来测试SARS-COV2的患者样品,并为其他实验室提供了一个想要做同样的实验室的蓝图。
“就像全国其他基础生物实验室一样,由于流感大流行,我们被迫关闭了运营,”血液和肿瘤学部医学副教授、资深作者乔治·墨菲说。“我们看到我们在波士顿医疗中心的朋友和同事们奔赴疫情前线作战,但是他们不得不等待7到10天才能得到国家和商业实验室的结果。这让我们无法接受,于是我们决定采取行动。”
墨菲通常是波士顿大学和波士顿医疗中心(BMC)再生医学(CREM)中心的联合主任,并专注于干细胞研究。作为干细胞和分子生物学家,他和实验室的成员具有广泛的经验,开发和运行定量的实时逆转录酶聚合酶链反应(QRT-PCR)测定的类型,以检测病毒RNA的存在需要患者样品。
更大的挑战是使他们的实验室适应严格的政策,以运行临床实验室改进修正案(CLIA)认证,美国病理学家学院(CAP)认证的诊断实验室。该团队向FDA申请并获得了重新利用实验室的紧急许可,不到一周就开始运作了。截至2020年4月20日,他们已经测试了3000多个样本,样本周转时间不到24小时。近45%的检测呈阳性,这一数字很大,部分原因是由新英格兰最大的安全网医院BMC服务的高危人群。
“大约一个月左右,我们是镇上唯一的比赛,”墨菲笔记。“向大型商业实验室发出的样本的结果占据了一周,但即使是等待时间为24小时,延迟了关于是否需要孤立的决定以及珍贵PPE是否需要孤立的能力[个人保护应该使用设备。“
该团队开发了一个测试这可以通过可能仍然可用的技术和试剂来完成。该测试还设计有能力在该过程的每个步骤中使用不同的试剂。“我们的”家庭啤酒“测定非常灵活,允许我们在多点的各种试剂中插槽,并消除潜在的供应链问题,”墨菲说。
他预计测试的必要性不会很快下降。他说:“虽然我们已经度过了这场大流行的早期阶段,包括在迫切需要的时候对重症患者和有症状的患者进行检测,但每个人都将很快需要过渡到无症状检测和监测检测。对于大型商业实验室来说,要应对这将需要的大量样本可能极其困难,”Murphy说。“我们决定分享我们所做的事情,这样其他机构就可以实施自己的内部测试。”
该团队还在寻找扩展到其他类型的测定,包括基于唾液的测试。
墨菲信用他的同事和合唱团,包括Laboratorian Chris Andry,Pathologist Nancy Miller和Bioincommatic Tayle Matte,如此迅速地汇集了这项测试计划。“我们认为,公众在这些非常具有挑战性的时期看到积极的东西很重要,”他结束。“这个项目是科学家,临床医生,诊断实验室技术人员和管理员聚集在一起的合作和团队合作的精彩典范,以解决一个看似难以忍受的问题。”
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