新的诊断方法发现激进的肿瘤

Karolinska Institutet在瑞典的研究人员开发了一种新的便宜方法，可以识别高度异质的肿瘤，往往是非常侵略性的，因此需要更积极地待遇。该技术在科学期刊中呈现自然通信。

癌细胞的常见特征是在基因组中存在每种染色体或基因的拷贝数的变化 - 一种称为拷贝数改变或CNA的现象。在同一肿瘤内，属于肿瘤的不同解剖部分的细胞可以携带不同的CNA。对于许多CNA的肿瘤通常是非常激进的并且往往甚至在恶劣的治疗之后更频繁地改革。

现在，瑞典的Karolinska Institutet和Scietents（Scilifelab）的Bienko-Crosetto实验室已经开发出一种名为Cutseq的新基因组方法，可以评估同一肿瘤的许多不同部分中的CNA的数量和类型比现有技术要较低。

“我希望Cutseq找到许多有用的应用程序癌症诊断，“医学生物化学和生物物理学系，Karolinska Institutet系的高级研究员尼古拉克罗萨蒂说，以及本文的高级作者。”多区肿瘤测序将越来越多地用于诊断环境，以便鉴定需要更积极地治疗的高度异质肿瘤的患者。我相信我们的方法可以在这里发挥主导作用。“

该方法适用于从多个活检中提取的DNA，甚至来自薄组织切片的非常小部分 - 病理学家通常依赖于在显微镜下诊断癌症的样本类型。

通过用独特的分子条形码标记从相同肿瘤样品的多个区域提取的DNA，可以通过单次测序实验获得肿瘤中CNA的异质性的综合图像。

根据新方法背后的研究人员，根据研究人员，Cutseq的应用不仅限于癌症诊断。

“例如，CutSeq可以用作细胞系认证的平台，并监测大型电池线储存库和生物人群中的基因组稳定性，”同一部门和本文其他高级作者的高级研究员Magda Bienko说。“它也可以应用于生态学，作为其他降低的代表性基因组测序方法的替代方法，例如RAD-SEQ，以具有成本效益的方式评估生物多样性。”

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