沙门氏菌，基因交换和抗生素耐药性：五个问题与sid thakur

希德·塔库尔(Sid Thakur)是人口健康和病理生物学教授，也是北卡罗来纳州立大学和兽医学院全球健康项目的主任。他研究沙门氏菌的抗生素耐药性，以及耐抗生素沙门氏菌如何影响食用动物和人类群体。在他的最新研究中，Thakur比较了超过200种不同的沙门氏菌菌株的基因组，寻找不同菌株之间的基因相似性。他在《摘要》上谈到了这项工作能告诉我们什么，以及它如何帮助我们和我们的食品供应安全。

摘要(TA):在这篇文章中，你比较了200种不同的沙门氏菌菌株的基因组，它们分别取自人类、猪、鸡和农场环境。还有更多种类的沙门氏菌吗?

Thakur：沙门氏菌有超过2,500种不同的血清型。我们通常在爆发期间遇到的常见常见包括伤寒村，海德堡，肠炎，纽波特，4 [5]，12：我： - 和穆健安，名称几个。许多这些血清型都是主持人适应，这意味着它们主要出现在一个主体中 - 例如，肠炎虫通常在鸡蛋中发现。许多其他人存在于多个宿主中 - 触发器发生在人类，动物和环境中。

你为什么选择你选择的菌株?

Thakur：主要原因是因为这些菌株与包括人，动物和环境的多个来源分离。这些菌株对人类最近的许多爆发负责，我们希望确定来自多种来源的这些沙门氏菌血清型是否具有类似或不同的特征。最后，许多这些菌株对多种抗菌剂抵抗力，重要的是要比较它们的基因组型材，因此我们可以理解什么使它们抵抗力。

比较不同沙门氏菌株的DNA能告诉我们什么?

Thakur：基因组比较可以揭示许多信息，即PCR缺乏的其他基于分子的方法。我们可以识别类似或不同的基因组区域。我们可以进入洞察力耐药性多重基因组的毒力图谱以及了解不同菌株在不同选择压力下是如何进化的。基因组比较可以帮助我们了解不同菌株是否在交换基因组物质，识别新的致病性菌株然后比较全球层面的资料。

不同的沙门氏菌菌株可以交换基因。他们为什么要这样做?有预防的方法吗?

塔库尔:病原体不断进化，试图对抗它们遇到的有害环境。达尔文的“适者生存”原则在这里是正确的。如果病原体不进化，它们就无法生存。沙门氏菌就是一个很好的例子，这种病原体的特定血清型在基因组水平上更加多样化。一个很好的例子是鼠伤寒沙门氏菌，它是一个不同的血清型，因此有能力在多个宿主中生存。基因组的灵活性允许病原体改变它们的DNA，在很多情况下，还可以与其他病原体交换基因。因此，鼠伤寒是人类通过不同宿主(包括食品和环境)接触到它的多次暴发的原因。基因和基因组物质的交换是一个持续的过程，很难控制和防止。这就是为什么这个领域如此具有挑战性和令人兴奋的同时工作。

TA：工作中最有趣的结果是什么？有什么惊喜吗？

Thakur：我们检测到跨多个宿主的不同沙门氏菌血清型之间的密切关系，可能指示从动物传播感染到人的感染。我们还比较了不同的方法来改善我们使用基因组数据创造的沙门氏菌的分辨率。我们鉴定了相同的药物抵抗基因，质粒类型和分布在多个宿主的毒力基因 - 以及转换的宿主数量和程度令人惊讶和有趣。

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