艾伦脑科学研究所数据库发布了近两倍的小鼠脑细胞数据

艾伦脑科学研究所今天宣布发布了新的数据，分析这些数据的工具，以及一个新的基于网络的3d查看器，用于探索老鼠大脑的解剖结构和连接艾伦大脑探索者．今天发布的数据几乎使Allen细胞类型数据库中的小鼠细胞数量翻了一番，从1000多个细胞增加到1900多个细胞，同时为Allen小鼠大脑连接图谱增加了新的神经元连接信息，并增加了更多来自小鼠、人类和猕猴脑细胞的单细胞转录组学数据。

包含的数据集的增长艾伦脑图谱允许艾伦脑科学研究所和更广泛的神经科学界的研究人员将脑细胞分为不同的类别，这有助于研究人员更多地了解哺乳动物的大脑及其多样性，这是创建脑细胞类型“周期表”的持续努力的一部分。艾伦脑科学研究所(Allen Institute for Brain Science)技术副主任冯大卫博士(David Feng)说，随着数据的积累，这些分类提供了对细胞复杂性更丰富的描述。

“我们使用细胞的不同方面——它们的基因活动，它们的形状，它们发送信息的地方，它们的电行为——来提出具有生物学意义的分类，”冯说。“了解大脑细胞的特性是理解大脑如何工作的关键一步。”

由于大脑非常复杂，艾伦脑科学研究所的研究人员需要从数以万计的脑细胞中收集大量数据，以可靠地分类不同的脑细胞细胞并开始理解这些分类的含义。

除新老鼠大脑通过与华盛顿大学医学院和瑞典神经科学研究所的合作项目，今天发布的细胞数据包括人类和猕猴大脑单细胞水平的数据。这些宝贵的数据集为研究人员提供了对人类和动物大脑之间差异的深入了解，这些差异被用于模拟人类疾病。

艾伦脑科学研究所分子遗传学副主任Bosiljka Tasic博士说:“影响大脑的疾病可能始于大脑的特定部位，甚至是特定的细胞类型。”“要知道疾病的起源，以及最终如何治疗它，我们必须了解大脑的各个组成部分。”

今天还发布了两个新的数据分析工具的测试版。其中一个是Allen Brain Explorer，这是一个基于网络的应用程序，允许用户可视化鼠标大脑三维解剖和连接。以前，这个工具只能作为桌面应用程序使用;现在，用户可以通过网络浏览器访问浏览器。第二个工具，叫做RNA-Seq数据导航器，使研究人员可以可视化的分类大脑细胞基于他们的基因相似模式。这些开放的数据分析应用程序加入了一个丰富的工具包，供世界各地的临床医生和神经科学家免费使用。

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