基因组调查显示,基因表达的异常引发位点可能促进胃癌

基因组调查显示,基因表达的异常引发位点可能促进胃癌
组蛋白蛋白质的核心复合物,其支持和组织染色体DNA(绿色)还调节附近基因的活性。信贷:通过Wikimedia Commons从核心结构和CC By-SA 3.0下授权核心©Richard Wheeler(Zephyris)

*星级研究人员表明,组蛋白修饰的变化加速了一种被称为胃腺癌的胃肿瘤 - 一种癌症,这些癌症在亚洲群体中比西方人群更频繁地发生。

尽管通常含有许多基因组突变,即改变遗传活性的遗传活动,这些突变负责扩散和迁移,其他“表观遗传”机制也在发挥作用。例如,支持染色体DNA(见图)的组蛋白蛋白可以经历可以促进或抑制的化学修饰

由帕特里克谭的研究团队由Saparyapore of Singapore of Singapore of Singapore of Singapore使用了一种称为纳米级染色质免疫沉淀序列测序(纳米芯片-SEQ)作为研究胃腺癌的起点的技术。该技术在*星中开发,允许研究人员特异性分析在不同基因组位点发生的染色质修饰,使得可以预测最可能在给定细胞中活跃或无活性的基因。

通过比较胃腺癌和正常胃组织的纳米芯片SEQ分析,谭和同事鉴定了数百种基因组位点,具有不同差异的组蛋白改性。尽管在已知的启动子序列中观察到许多这些差异,但调节附近基因的活性 - 在“隐秘启动子”中发现了许多尚未描述的序列。

这些非常规的启动子似乎是深刻的改变基因表达。在几个情况下,研究人员确定了隐秘启动子有助于产生异常蛋白质变异。患者肿瘤样本的分析表明这些变化可能直接影响患者的健康。

“胃癌表达这种改变基因的患者经历了非常差的临床结果,这表明隐秘启动子可以在功能上有助于侵略性疾病,”TAN说。

促进剂中包含的序列元素充当各种“着陆平台”直接治理基因表达。谭和同事发现,许多神秘的癌症相关的启动子被转录因子结合,所述转录因子形成多元菌压缩体复合物2(PRC2),其有助于组蛋白改性的转录因子组件。重要的是,PRC2在胚胎干细胞中也非常活跃,胚胎干细胞在生物化学上锁定到“未成熟”的发育计划中。

“这表明胃癌可能会”回归“更原始的状态,在很早期发展期间表现出类似于细胞的性质,”Tan说。

虽然这项研究只提供了一个特定癌症的初始数据,但Tan认为该平台有可能提供仿形表观遗传异常的一般策略,这可能会通知对其他肿瘤类型的诊断和治疗。


进一步探索

发育基因表达的调节以预期的相反顺序发生

更多信息:Muratani,M.,Deng,N.,OOI,W.F.,Lin,S. J.,Xing,M.等。“胃腺癌的纳米级染色质曲线揭示了癌症相关的神秘启动子和组织上获得的监管元素。”自然通信5,4361(2014)。dx.doi.org/10.1038/ncomms5361
信息信息: 自然通信

引文:基因组调查显示,基因表达的异常发起位点可能促进胃癌(2014年9月10日)从HTTPS://MedicalXpress.com/news/2014-09-genomic-survey-reveals-abnormal -sites检索胃癌(2014年9月10日)。HTML.
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