新发现的肠道病毒生活在世界人口的一半

奇怪的是,有一个住在你的肠道病毒,已被科学家几十年了。一项新的研究由圣地亚哥州立大学的研究人员发现,超过一半的世界人口是描述一个新病毒宿主,名叫crAssphage,感染最常见的一种类型的肠道细菌,拟杆菌门。这个门的细菌被认为是与肥胖、糖尿病和其他gut-related疾病。这项研究刊登在今天自然通讯。

罗伯特·爱德华兹、圣地亚哥大学生物信息学教授和他的同事们发现纯属偶然。工作与来访的研究员和这项研究的共同作者Bas e . Dutilh现在荷兰内梅亨大学医学中心的研究人员利用从先前的研究结果gut-inhabiting病毒屏幕上的新病毒。

DNA粪便样本中12种不同的个体,他们注意到一个特定的病毒DNA的集群,长约97000个碱基对,样品都有共同之处。当爱德华和他的同事检查这一发现对已知病毒的一个全面的清单,他们是空的。

研究人员然后筛查病毒跨数据库的全国卫生研究所的人类微生物组计划(HMP)和阿贡国家实验室的MG-RAST数据库,再次发现它在丰富源自人类粪便样本。

证明他们发现的病毒DNA计算机数据实际上存在于自然,研究员圣地亚哥大学的病毒学家约翰Mokili使用一种称为DNA扩增的技术来定位原始样本中的病毒用于构建NIH的数据库。

“我们有一个生物证明他们发现这种病毒与计算机实际上存在于样本,“Mokili说。

这是一个新的病毒,大约一半的取样人体内,没有人知道。

“这不是不寻常的去寻找一种新的病毒和找到了,”爱德华兹说。“但这是非常不寻常的发现很多人的共同点。它的雷达这么长时间是很奇怪。”

一个古老的病毒

事实上,它是如此普遍表明它可能不是一个特别年轻的病毒,。

“我们基本上在每个人口我们看着,”爱德华兹说。“据我们所知,这是和人类一样古老。”

之后,他和他的团队名叫病毒crAssphage cross-assembly软件用于发现它。

一些蛋白质crAssphage的DNA类似发现在其他很好的描述病毒。让爱德华兹的团队确定病毒,他们的小说是一个称为噬菌体,感染和复制在细菌和使用创新的生物信息学技术,他们预测,这个特定的噬菌体遍布通过感染常见的肠道细菌称为Bacteriodetes门。

肠穿孔

Bacteriodetes肠道的细菌生活快结束时,他们被怀疑发挥重要作用之间的联系肠道细菌和肥胖。crAssphage在这个过程中扮演了什么角色将是未来研究的目标。

更多细节关于crAssphage很难得到。未知的病毒是如何传播的,但事实并不是发现在非常年轻的婴儿的粪便样本表明,它不是通过母亲般地,但期间获得的童年。病毒DNA的结构表明,它的循环结构。进一步的实验室工作证实病毒DNA是一个单一的实体,但它证明难以分离。

“我们知道它在那里,但是我们不能捕捉它,”爱德华兹说。

一旦病毒是孤立的,他希望深入研究它在肥胖中的作用。在某些方面有可能病毒介导的活动Bacteriodetes殖民地,但crAssphage是否促进或抑制肠道与肥胖相关的流程还有待观察。

病毒也可能被用来预防或减轻其他疾病影响糖尿病、胃肠病等肠道疾病。

更好的理解这些过程之后,爱德华设想有一天个性化医疗基于这种病毒的可能性。

“这可能是一个个性化的噬菌体医学的关键,”他说。“在个人,我们可以分离您的特定的病毒株,操纵目标有害细菌,然后还给你。”