禽流感变体秸秆埃及

（欧宝娱乐地址医学Xpress） - 在亚洲的第一次鉴定，高度致病性禽流感 - H5N1 - 在科学界造成了重大报警。虽然病毒的主要目标是鸟类 - 数千万已经死于它 - 它能够感染哺乳动物，包括人类，引起严重疾病和令人恐惧的死亡率。

在一项新的研究中，亚利桑那州立大学生物选择研究所的研究员Matthew Scotch追踪埃及H5N1变种的传播 - 一个最近被确定为病毒的主要震中的国家。在最近出现在杂志的结果中BMC基因组学，苏格兰威士忌使用称为Phylogeography的技术跟踪H5N1案例的扩散。

作者希望对这种类型的研究能够大大提高公共卫生官员识别病毒爆发的努力，限制其传播，协调疫苗接种努力，减少死亡率，更好地通知公众风险。

“埃及代表了H5N1的震中，并且有新的变体已经出现，因为它于2006年首次发现了2006年，”苏格兰威士忌说。“我们使用过植物地理和流感基因组序列来模拟病毒的扩散和演化。”

Phylogeography出生于生物地理和系统发育的领域，或分子演化。通过将病毒序列数据和地理信息相结合，以及评估与病毒载体相关的功能，研究人员可以更好地了解通过动物和人类人群横跨景观的病毒如何传播。

已经建立了Phylogeapache作为研究人类疾病的病毒分散的强大技术，包括登革热，狂犬病，流感和艾滋病毒。近期植物流感研究近期应用的近期应用，显着提高病毒源和蔓延的细粒度映射。

禽流感H5N1是一种流感A - 一种RNA病毒 - 1997年首次在香港确定的RNA病毒。H5N1的最初病例显然不会有效地在鸟类中传播。然而，在2002年，H5N1的新分离株出现，导致鸭子中的急性疾病，导致神经功能障碍和死亡。

受感染的鸟类通过鼻中分泌物，唾液，粪便和血液互相传递H5N1。其他动物，包括人类，可以通过与禽体液或污染的表面直接接触来感染病毒。

H5N1的人类病例通常由与受感染的家禽接触，特别是在现场鸟市场和农场中，被认为是病毒的主要水库。然而，Avian H5N1也被鸟类的鸟类携带，这进一步将H5N1传播到世界其他地区。

2004年，研究人员发现，H5N1是比最初假设的，攻击水禽，鸡，乌鸦，鸽子和鸭等更有效的病原体，以及哺乳动物，产生高死亡率。禽流感现在被认为是一个重要的全球健康威胁，具有国际大流行的真正前景，造成普遍的死亡。

实际上，人类收缩H5N1的死亡率估计约为60％，使受感染的个体的致命性比西班牙流感更致命 - 一种遗传上类似的菌株，在1918年大流行期间造成50-100万人。

目前，H5N1对来自鸟类的人类并不高度传播，并且人类对人类传输速率非常低，但报告了大约左右的病例。如果少数突变呈现H5N1更容易在人类中传播，则会满足致命流行的条件。

除了突变，混合形式流感病毒- 被称为重配菌株 - 当单个个体感染有两个版本的给定病毒和交换基因时，可以发生。H5N1重新排列可以使禽流感易于在人体宿主之间传播。

在新的研究中，在埃及观察到标记为2.2.1.1的H5N1的特定变体。那里，禽流感据世界卫生组织称，已经造成了数千只鸟并造成了173例人类案件，其中63岁于2013年12月10日致命。这些是亚洲外部H5N1的最高案例。与亚洲H5N1一样，专家们将大多数人类感染与患病的家禽接触，特别是在Live Bird Markets。

在他们试图确定埃及病毒的起源和传播，研究人员利用了苏格兰教授创建的新软件平台。被称为Zoophy，该程序能够实现H5N1扩散的Phyloge分析。

这禽流感病毒H5N1从两种装饰病毒表面，血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）的穗状花序中的名字。A型或B型流感病毒使用血凝素连接到细胞表面受体中，允许细胞的病毒感染。神经氨氨酸酶后后，用来从受感染的细胞中除去这些受体，允许新合成的病毒颗粒逸出和感染其他细胞。

在流感病毒中，有17种不同类型的血凝素，从H1到H17，来自N1至N9的九种不同类型的神经氨酸酶。每个病毒具有一种H（例如H5）和一种类型的N（例如N1）。

通过分析226公顷和92个Na序列，苏格兰威士查赛及其同事利用了一种追溯了埃及H5N1的优势和传输路线的神奇地理方法。由于短的基因组序列和快速的进化速度，Phyloography是一种特别富有成效的动物 - 人或动物肠病病毒的方法。

本集团的调查结果显示，埃及四个主要区域的2.2.1.1病毒形式的2.2.1.1病毒形式的地理蔓延：开罗，尼罗河三角洲，运河和上埃及。统计分析表明，Ash Sharqiyah的北方省作为H5N1传播的目的点，但数学关联太弱而无法索取确定性。分析还暗示，H5N1的最强传输路线是从Ash Sharqiyah到Al Gharbiyah和Al Fayyum到Al Qalyubiyah。

大多数已识别的传播路线出现在埃及的密集三角洲地区。Al Qalybiyah政府特别似乎是病毒转型的流行区域，但是往返该地区的分散仍然不确定，需要进一步研究。该研究还通过有限的时间框架注意到了相当大的病毒多样性 - 也许对全国各种家禽疫苗接种计划的回应。

“这对世界其他地方具有重要的公众卫生影响，”苏格兰威士忌说。“重点关注变体的落叶，以便更好地了解该病毒如何发展，并且省份传播其传播。”

作者进一步开发了Zoophy软件的图形界面。该工具不需要专业知识，文化地理或生物信息化学，使现场使用方便公共卫生官员。通过在贸易路线归零 - 病毒传输的迁移模式和高速公路 - 卫生当局可以保护有限的资源，将它们应用于它们最有效的地方。

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